印记是提升精灵战斗力的重要系统之一，主要通过附魔功能实现属性加成。玩家可通过打开战队界面，选择主角精灵并点击附魔选项进行操作，每次附魔会消耗金币或特定材料，成功后可增加攻击、防御等基础属性，但附魔存在成功率设定，失败时不会损失材料仅消耗金币。印记等级最高可提升至12级，部分高级印记还能激活特殊效果，例如弗里德印记达到满级后可解锁赠送奖励。印记的合理搭配能显著优化阵容强度，尤其在PVP或高难度副本中发挥关键作用。
印记系统与精灵培养深度结合，不同阶段的阵容对印记需求各异。例如前期阵容以次王、斗神、妖王、青龙为核心，中期过渡至雷伊和咤克斯，后期则依赖天邪、邪冥兽等精灵，而印记能弥补精灵成长中的属性短板。印记属性分为固定数值加成和百分比加成两类，后者在精灵后期培养中收益更高。玩家需注意，印记效果不受精灵伤害减免或防御属性影响，例如易伤类印记会直接按比例提升所受伤害，这类特殊效果在战术安排上具有较高优先级。
获取印记的主要途径包括噩梦副本、活动奖励及商城兑换。90级开启的噩梦副本是稳定产出印记的渠道，但需消耗大量金币进行合成与附魔，因此前期积累金币尤为重要。部分限时活动或VIP礼包会提供稀有印记，如妮可萝、蒙娜丽莎等土豪阵容专属印记。印记分解后可能返还万能碎片、经验芯片等资源，但超进化精灵的印记分解时需谨慎，部分会返还超进化道具。
印记系统的策略性体现在阵容守护的搭配上。玩家可在战队界面切换大地守护、月神守护或青龙守护等类型，不同守护对印记属性有协同增益。例如大地守护能强化防御类印记效果，而青龙守护则偏重攻击加成。刻印系统与印记存在联动，部分刻印会额外提升印记触发概率或效果持续时间，需根据精灵定位选择适配组合。
印记系统是赛尔号超级英雄中兼具养成深度与战术灵活性的设计，其作用不仅限于数值提升，更能通过特殊效果改变战斗节奏。玩家需结合金币规划、副本进度及阵容演变进行动态调整，以最大化印记收益。
